Institusi ini dipimpin oleh seorang Kepala Kepolisian Daerah (Kapolda) yang bertanggung jawab mengendalikan seluruh pelaksanaan tugas kepolisian di wilayah hukumnya. Dalam menjalankan tugas tersebut, Kapolda didukung oleh Wakapolda serta berbagai biro, direktorat, dan satuan kerja yang memiliki fungsi berbeda.
Wilayah kerja Kepolisian Daerah Papua Barat Daya meliputi beberapa kabupaten dan kota yang berada dalam administrasi provinsi tersebut. Luas wilayah dengan karakteristik geografis yang beragam membuat kepolisian harus memiliki strategi pelayanan yang efektif agar dapat menjangkau seluruh lapisan masyarakat.
Selain menjalankan fungsi penegakan hukum, Kepolisian Daerah Papua Barat Daya juga terus meningkatkan pelayanan publik melalui berbagai inovasi. Langkah tersebut bertujuan memberikan kemudahan bagi masyarakat dalam mengakses layanan kepolisian sekaligus memperkuat kepercayaan publik terhadap institusi Polri.
